浦南歷史悠久，早在原始社會就有人類活動。唐總章二年(669年)陳政率府兵平蠻嘯亂，就是從浦南香州(今溪園村)渡江，進軍龍溪縣。唐景龍二年(708年)在浦南創辦松州書院，系全國最早的講學書院。清代，駐有綠營旗，設檢查站，稱浦南汛。
浦南鎮自元、明、清至民國初期，浦南水陸交通方便，集市繁榮，歷史上是漳平、華安、安溪、長泰等地土特產集散地，尤以糖、紙為著。清代設有聞名閩南的造紙坊。集鎮房舍沿江由東向南建築，成方塊狀。
今浦南鎮境地秦時屬閩中郡；漢元封元年（公元前110年）屬會稽郡，建安初年屬會稽郡侯官縣；三國時吳永安三年（260年）屬揚州建安郡東安縣；晉太康三年（282年）屬晉安郡晉安縣。南朝梁武帝大同六年（540年）置龍溪縣，隸屬南安郡，境地屬龍溪縣。隋大業三年（607年）屬建安郡龍溪縣。唐武德五年（622年）屬豐州（治在南安）龍溪縣；貞元初廢豐州並入泉州（治在今福州）；嗣聖元年（684年）析泉州的莆田、南安、龍溪置武榮州（治在南安），境地屬武榮州龍溪縣。
唐垂拱二年（686年）析龍溪縣南境置漳州。其時，境地仍屬武榮州龍溪縣；景雲二年（711年）改武榮州為泉州（治在晉江），境地屬泉州龍溪縣；開元二十九年（741年）割泉州的龍溪縣屬漳州，境地屬漳州郡龍溪縣；天寶元年（742年）改漳州為漳浦郡，境地仍屬龍溪縣；乾元二年（759年）漳浦郡復名漳州；貞元二年（786年）漳州州治遷於龍溪縣鳳高山桂林村（今屬薌城區），龍溪縣成為附廓縣，境地屬之。
南唐保大四年（946年）漳州改稱南州，境地屬南州龍溪縣。
宋乾德四年（966年）南州復名漳州，境地屬漳州龍溪縣。
元至元十六年（1279年）漳州改為漳州路，境地屬漳州路龍溪縣。
明洪武元年（1368年），改漳州路為漳州府，境地屬漳州府龍溪縣二十三、二十四都；清仍屬漳州府龍溪縣二十三、二十四都。
民國元年（1912年）改漳州府為福建省西路道，龍溪縣屬之，境地屬龍溪縣第三區；民國3年西路道改為汀漳道；14年廢道，龍溪縣隸屬福建省；22年龍溪縣屬龍汀省；民國23年7月，龍溪屬第六行政督察專員公署；翌年10月，改第六為第五行政督察公署，境地仍屬龍溪縣第五區(浦南區)的南洲鎮(轄8個保)、滄浦鄉(轄8個保)。
民國26年，境地仍屬第五行政督察公署龍溪縣。
1949年9月19日龍溪縣城解放；20日龍溪縣全境解放。境地屬中國人民解放軍軍事管制委員會龍溪縣人民委員會第五區；10月，龍溪屬福建省第六行政督察專員公署，境地仍屬龍溪縣。
1950年4月1日，境地屬漳州行政督察專員公署龍溪縣；10月，改屬福建省人民政府龍溪地區專員公署龍溪縣第八區。1956年，境地屬龍溪縣石亭區的浯倉鄉、鰲浦鄉、宏道鄉、浦南鎮；1958年撤區並鄉，浦南鎮屬石亭鄉；同年9月撤銷鄉的建制，成立星火人民公社，境地屬龍溪縣星火人民公社。1959年3月，浦南鎮屬龍溪縣浦南公社。
1960年8月，國務院批準龍溪、海澄合並為龍海縣，浦南公社屬龍海縣。
1961年6月，浦南公社由龍海縣劃歸漳州市（今薌城區），並析為浦南、浦林、石亭3個公社。
1967年6月，境地屬龍溪專區漳州軍事管制委員會；1968年4月，成立浦南、石亭人民公社革命委員會，隸屬漳州市革命委員會。
1980年8月浦南、浦林合並為浦南公社；1980年10月，漳州市革命委員會改為漳州市人民政府；12月浦南人民公社革命委員會改為浦南人民公社管理委員會。
1984年10月，浦南人民公社管理委員會改為鎮人民政府。
1985年05月14日，經國務院批準，7月20日撤銷龍溪地區行政公署，漳州市升為地級市，9月21日原漳州市建制改設薌城區（以境內九龍江西溪別稱薌江而得名），浦南鎮屬漳州市薌城區。
1986年，薌城區分為市區、郊區2部分，浦南鎮屬郊區。