壹是土地權屬有爭議，未解決；
二是土地違法行為尚未處理或者正在處理的；
三是申請土地權利超過規定期限的；
四是沒有合法用地等土地登記要求；
第五，違反規劃改變土地用途；
第六，在查封登記解除前申請登記；
七是未經土地使用權登記而設定抵押的；
第八，其他未依法登記的。不予註冊和認證的，壹般應當書面告知申請人不予註冊和認證的理由。
擴展數據:
土地權屬爭議案件的責任主體:
1.個人之間、個人與單位之間、單位之間的爭議，由爭議土地所在地的縣級國土資源行政主管部門調查處理。個人之間或者個人與單位之間的糾紛，經當事人申請，可以由鄉級人民政府受理和處理。
2.設區的市、自治州國土資源行政主管部門查處下列爭議案件:跨縣級行政區域的爭議案件；同級人民政府、上級國土資源行政主管部門交辦或者有關部門轉送的。
3.省、自治區、直轄市國土資源行政主管部門調查處理下列爭議案件:跨設區的市、自治州行政區域的；爭議壹方為中央國家機關或其直屬單位，且涉及土地面積較大的；爭議的壹方是軍隊，涉及大片土地；在本行政區域內有重大影響的；同級人民政府、國土資源部交辦或有關部門轉辦。
4.國土資源部調查處理下列爭議案件:國務院交辦的；在全國有很大影響。
百度百科-土地權屬糾紛調查處理辦法