這主要包含兩層意思:
1，學校的管轄範圍是教育部管轄，那麽高校的人事任命權屬於教育部，地方政府和教育部門不具備這些高校的人事管轄權。所以大家可以看到，比如重慶的重慶大學和西南大學，四川的四川大學，西南交通大學，四川的西南財經大學和電子科技大學，湖南的湖南大學和中南大學等等。都是教育部直屬高校，其高層任免權集中在教育部。
2.學校的財務收支屬於教育部，也就是說，教育部直屬高校的經費來源是教育部撥款，而不是地方撥款。很多網友在高考錄取計劃分配和地方教育發展的討論中，經常混淆這個概念，說某省市養了這麽壹所名牌大學，但招生計劃人數對當地來說太少了，經費應該減少。事實上，這些學校的經費最初主要來自教育部，而不是來自當地。當然，地方政府也可以和高校合作，提供壹些資金或者其他支持，在科研、地方經濟、各個領域互相合作。這是壹個非常有利於當地經濟發展的策略。