1，概念不同。註冊資本是指合營企業在登記機關註冊的資本總額，是合營各方繳納或承諾繳納的出資額之和。項目資本金是指投資者在建設項目總投資中認繳的投資額，為建設項目的非債務性資金，項目法人對該部分資金不承擔任何利息和債務；
2主要依據不同。註冊資本主要依據來自《公司法》、《公司登記管理條例》、《公司註冊資本管理規定》，項目資本主要依據來自國發[1996]35號、國發[2009]27號、國發[2015]51號。
3、適用範圍不同。註冊資本適用於有限責任公司、股份有限公司和其他企業；項目資本適用於經營性投資項目。
4.投資比例不同。新公司法取消出資比例限制，但金融機構等部分行業可能有特殊要求；項目出資比例在不同行業的項目中有不同的要求。
5.資金用途不同。對註冊資本的使用沒有明確的限制；股東持有其出資，但不得挪作他用。部分股份可以轉讓、質押，但不能抽回出資。項目資本金只能用於項目建設，其出資可以轉讓，但不能用於其他用途，更不能抽回。
項目資本金是指投資者在建設項目總投資中認繳的投資額，為建設項目的非債務資金，項目法人對該部分資金不承擔任何利息和債務；投資者可以按照出資比例享有所有者權益，也可以轉讓出資及其相應的權益，但不得以任何方式抽回。項目資本金制度是指除項目法人的債務資金外，還必須在項目總投資中批準壹定比例的資本金的項目管理制度。這是國家和國務院規定的，從1996開始執行的制度。對於壹個項目來說，資本必須是非債務資本。投資者可以按出資比例享有所有者權益，也可以轉讓出資，但不能抽回。國務院規定的總投資是項目的固定資產投資和流動資金之和，以批準的動態概算為依據進行審批。