公司對員工罰款是違法的。只有行政執法機關才能對公民的違法行為進行罰款，公司沒有罰款的權力，對員工罰款需要承擔相關的法律後果。但是，公司可以制定規章制度。如果員工違反公司制度，公司有權在規章制度或企業獎懲制度中對此類行為進行壹定的處罰；且因員工原因給公司造成直接經濟損失的，公司可要求其賠償損失。
中國關於罰款的法律規定
1，罰款的主體是行政主體。
不是所有的組織和個人都有罰款的權力，也不是所有的行政主體都有罰款的權力。只有法律、法規或規章授權的行政主體才有權實施罰款。在我們的現實中，許多不具備上述特征的組織違法行使罰款權；
2.罰款的對象只能是行政相對人。
特定行政主體的罰款權力不是無限的，只能對行政相對人進行罰款。任何組織都不能對其成員處以罰款，具有罰款權力的特定行政主體也不例外。
3.罰款的理由只能是違反行政法規。
罰款的本質是壹種行政處罰，這就決定了罰款只能針對違反行政法規的行為。其他行為，即使是違法行為，也不能罰款。在我們的現實生活中，罰款有很多種，大部分是因為沒有違反行政法規而被處以的。
綜上所述，用人單位無權處以罰款，勞動者因自身原因給用人單位造成經濟損失的，用人單位可以要求其按照勞動合同約定賠償經濟損失，每月扣款不得超過勞動者當月工資的20%。
法律依據:
《工資支付暫行規定》第十六條
因勞動者自身原因給用人單位造成經濟損失的，用人單位可以按照勞動合同的規定要求其賠償經濟損失。經濟損失賠償可從員工本人工資中扣除。但每月扣除額不得超過員工當月工資的20%。扣除的富余工資低於當地月最低工資標準的，按照最低工資標準支付。