對於《公司法》中的強制性條款，《公司章程》中的條款不能另行約定，否則相關條款無效。比如《公司法》第四十三條，股東會的討論方式和表決程序由公司章程規定，本法另有規定的除外。公司章程確定了公司制定的公司管理制度、經營制度等重大事項，壹般不能隨便變更。
章程的修改應依法進行，具體如下:
出席股東大會的股東，其所持有的每壹股份有壹票表決權。但公司持有的公司股份沒有表決權。股東大會的決議必須經出席會議的股東所持表決權的半數以上通過。股東大會作出修改公司章程、增加或者減少註冊資本的決議，以及公司合並、分立、解散或者變更公司形式的決議，必須經出席會議的股東所持表決權的三分之二以上通過。股東會的議事方式和表決程序由公司章程規定，本法另有規定的除外。
1.公司董事會作出修改公司章程的決議，並提出公司章程修正案草案。
2.股東大會將對公司章程的修改進行表決。有限責任公司修改公司章程，必須經代表三分之二以上表決權的股東通過；股份有限公司修改公司章程，必須經出席股東大會的股東所持表決權的三分之二以上通過。
3.章程修改涉及審批事項時，應報政府主管部門批準。股份有限公司為註冊資本發行新股的，必須向國務院授權的部門或者省級人民政府申請批準；如果是公開發行，必須經國務院證券管理部門批準。
4.修改章程涉及需要登記的事項的，應當報公司登記機關批準，並辦理變更登記；未涉及登記事項的，應當向公司登記機關備案。
5.章程修改涉及需要公告的事項的，應當依法公告。如果公司發行新股以籌集足夠的資金，必須按照法律或公司章程規定的方式進行公告。
6.修改公司章程，需要向公司登記機關提交《股東會決議》和《公司章程修正案》。涉及登記事項的，變更需公司法人簽字蓋章方可完成。