可分為“短期病假”和“長期病假”:員工因病或非因工負傷連續休假六個月的稱為“短期病假”，超過六個月的稱為“長期病假”。根據勞動部《關於加強企業職工病假管理保障職工病假期間生活的通知》，患病不滿六個月的職工:(1)連續工齡不滿兩年的，按本人工資的60%發放；(2)連續工作滿兩年不滿四年的，按本人工資的70%發放；(3)連續工作滿四年不滿六年的，按本人工資的80%發放；(4)連續工作滿六年不滿八年的，按本人工資的90%繳納；(5)連續工作滿八年及以上的，按本人工資的100%發放。員工可以根據其服務年限計算病假期間應得的病假工資。而如果員工患病超過六個月:(1)連續工齡不滿壹年的支付工資的40%；(2)連續工作1年以上不滿3年的，按本人工資的50%發放；(三)連續工作三年以上的，按工資的60%發放。(我這裏的工資是指正常情況下員工實際工資的70%。(4)職工疾病治療費用低於本企業月平均工資40%的，由企業按照用人單位依法制定的規章制度給予職工相應補貼。(五)職工病假工資高於上年度本市月平均工資的，可以按照上年度本市月平均工資計發。註意:各地細則不壹樣，也不是都這麽細。病假工資具體比例請咨詢當地人力資源和社會保障部門。無論如何，病假期間的工資不應該全部扣除，但只要不是長期病假，綜合計算的話，病假工資不會太多。所以最明智的方法就是當面詢問或者向公司舉報，因為壹旦申請仲裁，對員工以後的工作非常不利，仲裁費等費用可能比工資還多。
法律客觀性:
《企業職工患病或非因工負傷醫療期規定》第四條職工患病，在醫療期內6個月內停止工作接受治療的，其病假工資按下列辦法計發: (壹)連續工齡不滿10年的，按本人工資的70%發放；(二)連續工齡10年不滿20年的，按本人工資的80%計發；(三)連續工齡滿20年不滿30年的，按本人工資的90%發給；(四)連續工齡30年以上的，按本人工資的95%計發。